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目的：建立侵袭性感染丝状真菌的分子鉴定方法。方法：收集上海市公共卫生临床中心于2007年12月至2009年3月间分离的侵袭性感染丝状真菌26株，用真菌通用引物Itsl和Its4采用聚合酶链反应（PCR）扩增核糖体RNA基因序列，对PCR产物进行DNA序列测定，确定丝状真菌的菌种。结果：26株侵袭性感染丝状真菌中鉴定出黄曲霉5株．马内菲青霉4株．土曲霉、草酸青霉各3株，烟曲霉、禾谷镰刀菌各2株，日本曲霉、沙门柏干酪青霉、轮枝菌、塔宾曲霉、小麦壳针孢菌、球毛壳菌、李氏木霉各1株。结论：使用真菌核糖体RNA基因