【摘 要】
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植物铵转运蛋白(ammonium transporter, AMT)基因家族是重要的吸收与同化铵盐的基因家族,对调节植物的生长发育有重要的作用。AMT1基因家族属于高亲和铵态氮转运蛋白。为了解
【机 构】
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扬州大学农学院江苏省作物遗传生理重点实验室植物功能基因组学教育部重点实验室江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室; 扬州大学江苏省粮食作物现代产业技术协同创新中心;
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(31771771);江苏省高校自然科学基金(17JKB210006);国家大麦青稞产业技术体系建设专项(CARS-05);江苏高校优势学科建设工程资助项目共同资助
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植物铵转运蛋白(ammonium transporter, AMT)基因家族是重要的吸收与同化铵盐的基因家族,对调节植物的生长发育有重要的作用。AMT1基因家族属于高亲和铵态氮转运蛋白。为了解大麦AMT1基因家族成员在染色体上的分布、基因结构及组织表达性差异,本研究以公布的大麦栽培品种Morex的基因组数据为基础,在全基因组水平上采用生物信息学方法,以水稻、玉米、高粱、大豆、二穗短柄草和拟南芥AMT1基因家族为参考序列,利用同源比对的方法鉴定了大麦AMT1基因家族。结果表明,共鉴定出了5个AMT1基因,分别位于2H (HvAMT1.1, HvAMT1.2, HvAMT1.3)、3H (HvAMT1.4)和6H (HvAMT1.5)上,且这5个AMT1基因具有相似的编码区和核苷酸长度,串联重复事件是大麦AMT1基因家族的主要扩张方式;大麦AMT1基因的基因结构相似,不含内含子,只包含一个外显子;不同组织器官中HvAMT1基因的表达存在明显的差异,大麦HvAMT1.1和HvAMT1.3基因主要在幼苗期的根、茎和成熟期的衰老叶片中表达,大麦HvAMT1.5基因主要在大麦根系中表达,HvAMT1.2和HvAMT1.4基因在大麦所有组织器官中表达量都很低。本研究结果为大麦HvAMT1基因功能的解析提供了一定的参考。
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