【摘 要】
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为了揭示深水网箱养殖区养殖过程中浮游细菌群落结构及其与网箱养殖鱼类细菌性病害的关系，采用Illumina测序技术对海南后水湾深水网箱养殖水样进行16S rRNA基因高通量测序，结果表明，检测到浮游细菌种群归属于36个门、56个纲、98个目、235个科、807个属，香农-威纳指数范围为2.47～4.5，说明该养殖区水体中浮游细菌具有丰富的多样性。变形菌门是主要优势门类，其次为拟杆菌门、放线菌门、厚壁
【基金项目】
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海南省重大科技计划项目（ZDKJ2016011）；
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为了揭示深水网箱养殖区养殖过程中浮游细菌群落结构及其与网箱养殖鱼类细菌性病害的关系，采用Illumina测序技术对海南后水湾深水网箱养殖水样进行16S rRNA基因高通量测序，结果表明，检测到浮游细菌种群归属于36个门、56个纲、98个目、235个科、807个属，香农-威纳指数范围为2.47～4.5，说明该养殖区水体中浮游细菌具有丰富的多样性。变形菌门是主要优势门类，其次为拟杆菌门、放线菌门、厚壁菌门和蓝细菌门；主要类群为Cobetia属、弧菌属（Vibrio）、假交替单胞菌属（Pseudoalteromonas）、盐单胞菌属（Halomonas）等，不同养殖期优势类群差异较大，其中休养期以Cobetia属、玫瑰变色菌属和嗜冷杆菌属为主；养殖初期以Cobetia属、假交替单胞菌属、Kushneria属和弧菌属为主；养殖中期优势类群为Cobetia属、盐单胞菌属、交替单胞菌属（Alteromonas）、弧菌属和假交替单胞菌属；养殖后期优势类群为GpIIa属和Cobetia属。潜在致病菌弧菌属相对丰度在不同养殖期差异较大，在养殖初期、中期含量较高，而在非养殖期和养殖后期含量较低，与网箱养殖卵形鲳鲹细菌性病害发病规律相吻合，表明由于弧菌引起的鱼类病害为养殖区的主要细菌性病害类型。
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