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由于目前动物疫病种类多种多样，按国家农业部要求，新疆生产建设兵团根据实际重大动物疫病强制免疫有：牛、羊、猪的口蹄疫0型免疫，牛A型口蹄疫、牛羊0型-亚I型口蹄疫疫苗免疫，猪蓝耳病免疫，猪瘟免疫，禽类的新城疫免疫，禽类禽流感免疫等。工作要求一年必须集中免疫三次，做到团不漏连、连不漏户、户不漏畜、月月补防；重大动物疫病应免尽免100％。努力完成两个“确保”即确保不发生重大动物疫病、确保不发生重大畜产品质量安全事故。