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以番茄耐低温材料抗寒0号和不耐低温番青的F2为材料,利用正交试验设计对SRAP-PCR反应体系中的5因素（模板DNA、引物浓度、Mg2＋浓度、dNTPs浓度、TaqDNA聚合酶）在4个水平上进行正交优化试验。结果表明：各因素水平变化对反应体系影响的大小依次为：引物〉TaqDNA聚合酶〉dNTPs〉模板DNA〉Mg2＋。建立番茄耐低温SRAP-PCR的20μL最佳反应体系为：模板DNA为15ng、引物浓度0.75μmol·L-1、Mg2＋浓度2.0mmol·L-1、dNTPs浓度0.12