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持留菌是细菌群体中一小部分具有表型耐药的细菌。自1944年被发现后，近几十年来因其在慢性持续性感染和生物膜感染中的重要作用而得到越来越多的重视。已有的研究结果表明，细菌持留的机理复杂，涉及的相关信号通路有毒素-抗毒素系统、细胞能量代谢及蛋白核酸合成等生理状态的降低、DNA保护修复系统、蛋白酶系统、反式翻译、外排泵系统等。虽然不同细菌的持留机理有一定的相似性和保守性，但不同细菌的持留机制也存在差异，如毒素一抗毒素系统在大肠埃希菌（Escherichia coli）中的过度激活可导致持留菌增加，但在金黄色葡萄