目的比较宁波市鄞州区手足口病二级和三级防控模式的效果,评价其在手足口病等传染病疫情防控中的意义。方法 2009—2011年采用二级防控模式,2012—2014年采用三级防控模式开展手足口病防控。结合"中国疾病预防控制信息系统"中的疫情数据及鄞州区疾控系统手足口病防控档案数据,统计普通病例个案调查率、病例消毒药品接收率等5个率,并比较两种模式的机构职责分工、工作成本、工作负荷、防控实施效果与质量。结果二级模式和三级模式负责防控的机构数分别为25和308家,人数分别为31和314人,普通病例人均防控对象数分别为70和22例/年。二级模式的普通病例个案调查率(59.84%)、病例消毒药品接收率(70.46%)和病后电话随访率(79.40%)均低于三级模式的78.84%、91.67%和95.78%(P<0.01);三级模式的聚集性疫情调查率(100.00%)和入托入学病例管理率(100.00%)均高于二级模式的96.77%和90.30%(P<0.05)。结论二级模式适用于发病数量较少的手足口病疫情;三级模式适用于发病数量多的疫情,且能为应对重大传染病疫情提供参考经验。