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采用PCR－测序技术对采自抚仙湖的云南倒刺Ba5个个体进行了mtDNA D-loop区始自3'端共450bp碱基的序列测定。共检出2种单倍型。2个单倍型的差异是在第187碱基位置处发生一个T／C颠换。种内遗传多样性指数为0．135％。与鲫、银鲴等淡水鱼相比，云南倒刺Ba的遗传多样性程度比较丰富。在抚仙湖云南倒刺Ba的保护上，努力恢复其种群数量是首要且有可能的。