长白落叶松PAL基因SNPs筛选及木质素含量关联分析

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为探究长白落叶松PAL基因的多态性以及与木质素含量之间的关系,本研究以吉林省四平市林木种子园中120个长白落叶松无性系为材料,测量各无性系的木质素含量并对不同无性系进行PAL基因克隆及分析,具体结果如下:不同无性系间木质素含量差异达极显著水平,表明无性系间木质素含量差异较大,对其进行遗传改良意义重大;对3个落叶松无性系不同部位进行PAL基因克隆,发现不同组织均有该基因表达;对120个无性系PAL基因进行克隆、测序及分析结果共筛选出11个SNP位点,均位于基因编码区,其中有7个属于转换类型位点,4个属颠换类型位点;不同无性系间遗传距离范围是0.000~0.035 cM之间;关联分析结果发现4个与木质素含量显著相关的SNP位点(SNP116,SNP922,SNP1150和SNP1186),4个位点均是非同义突变位点,且除SNP116外,纯合突变型无性系木质素含量更高。该研究可以为长白落叶松分子遗传改良提供基础,也可以为其他树种分子育种提供借鉴。
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