肥胖者唾液微生物宏基因组学特点

来源 :北京大学学报(医学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:soboy1759
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:探讨肥胖者口腔唾液微生物的特点,比较肥胖者与正常体重者口腔唾液微生物组成、基因功能及代谢通路上的差异。方法:研究纳入无全身系统性疾病、无牙周炎及口腔黏膜病的肥胖者及性别、年龄相匹配的正常体重者,收集研究对象的非刺激性唾液。提取唾液样本DNA,用高通量测序方法进行宏基因组分析,结果经数据质控后进行物种分类及注释,差异物种线性判别分析(linear discriminant analysis,LDA),基因预测,基因集构建和功能注释分析。结果:过滤后每个样本得到可分类的、细菌的DNA序列平均条数为2 630 428。唾液微生物群落共包括11个菌门、19个菌纲、26个菌目、41个菌科、62个菌属和164菌种。肥胖组与正常体重组微生物群落的优势菌门相同,为变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和梭杆菌门,两组在纲、目、科、属、种等分类水平上均发现相对丰度差异具有统计学意义的物种。在纲水平上,Negativicutes纲和丹毒丝菌纲(Erysipelotrichia)丰度在肥胖组中的相对丰度高于正常体重组(P<0.05),黄杆菌纲(Flavobacteriia)和Bateroidetes纲在肥胖组中的相对丰度低于正常体重组(P<0.05)。9个菌属在两组间丰度差异具有统计学意义;种水平上,16个菌种的丰度差异具有统计学意义,其中产黑色素普雷沃氏菌(Prevotella melaninogenica)、唾液普雷沃氏菌(Prevotella salivae)、Solobacterium moorei和极小阿托波氏菌(Atopobium parvulum)等在肥胖组中相对丰度高于正常体重组(P<0.05),而血链球菌(Streptococcus sanguinis)在正常体重组中相对丰度高于肥胖组(P<0.05)。对基因预测结果进行分析,发现肥胖组样本基因数目较正常体重组多,差异有统计学意义(P<0.05),其中与营养和能量代谢、环境信息处理、人体疾病等通路相关的基因在肥胖组唾液样本中显著富集(P<0.01)。结论:肥胖者与正常体重者的口腔唾液微生物在物种组成、基因数目及代谢通路上均存在差异,值得今后扩大样本量进一步研究。
其他文献
土地资源可视化系统按照软件工程思想依次进行了系统总体的架构设计、系统网络结构设计、系统功能模块设计及系统研究技术路线。对系统的功能设计与实现进行了详尽的介绍,包
人体的各个部位(如肠道、口腔和皮肤等)生活着大量的微生物,这些微生物基因组的总和被称为宏基因组。人体内各种各样的微生物通过一系列相互关系构成了复杂的生态系统。然而,
不少诗人都是孤独的。但孤独的陈子昂内心却是充实的,超然物外,敢问苍天。古代文人对孤独常有感慨。屈原的《远游》中就有“惟天地之无穷兮,哀人生之长勤。往者余弗及兮,来者吾不
介绍了一种适合海底阀检测的装置及其检测方法。该装置可以高效、快捷地检测出海底阀气缸的密封性、海底阀结构的密封性及反向密封性,具有结构简单、操作方便、便于维护的优
一、工作启动情况中文古籍二十四史中保存了丰富的有关中亚地区(包括蒙古高原、河西走廊、青海、新疆、阿姆河和锡尔河流域、哈萨克斯坦草原南部、伊朗东北部、阿富汗北部以
全面预算管理和审计之间存在着一定的关系,要建立一套管理体系,就要保证所制定的管理体系的完善和发展,要处理好审计和预算管理二者之间的关系,有利于企业发挥更大的作用,实
近些年我国农业事业快速发展,农业推广力度不断加大,对种子管理服务工作提出更多要求。农业作为农村发展的根本与基础,粮食产量作为农业的重点与核心,需要保证种子更新换代才
以军队中心医院为依托,将军队基层医院与卫生队(所)作为中心医院一个分院模式建设信息平台,最大限度地共享资源,以此带动基层医疗机构信息化建设快速发展,实现与中心医院信息化
医学伦理教育的缺失主要表现为医学生的个人中心主义、利己主义思想和行为的存在,以及道德责任感和“敬畏生命”的伦理意识的缺乏。作者通过中外医学院校医学伦理学课程的产生