膀胱癌转移机制的生物信息学研究

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目的探讨膀胱癌转移的分子机制。方法运用生物信息学的方法,在基因表达综合数据库(Gene Expres ion Omnibus,简称GEO)数据库搜索下载符合纳入标准的芯片系列数据,分转移组和非转移组后用BRB-ar ay-Tools筛选出两组间的差异表达基因,对差异表达基因进行比对,在PATHER在线工具分析一致性高的上调或者下调基因。将差异表达基因在DAVID的KEGG进行富集通路分析。结果得到膀胱癌转移和非转移组差异表达基因中一致性高的基因,ALG13表达上调,CIB2表达下调。通过基因富集分析得到膀胱癌转移的可能通路。结论膀胱癌转移组和非转移组差异表达基因富集的通路主要有:P53信号通路,Wnt信号通路,TGF-β信号通路,P53、VEGF、ErbB等信号通路,磷脂酰肌醇信号通路,mTOR通路,MAPK信号通路。这些通路的主要效应为调节肌丝蛋白和细胞骨架,其次为细胞的增殖、分化、新生血管形成和免疫反应等。
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