副本交换分子动力学模拟方法计算Trp-cage熔解温度

来源 :山东师范大学学报：自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：myjob3

【摘要】

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副本交换分子动力学模拟方法用来计算Trp-cage小蛋白的熔解温度.此模拟采用的是AMBER03的分子力场,但是它的电荷用最近发展的极化的蛋白质专一性电荷来代替.隐式溶剂模型用来

【作者】

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段莉莉扈国栋张庆刚

【机构】

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山东师范大学物理与电子科学学院

【出处】

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山东师范大学学报：自然科学版

【发表日期】

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2009年3期

【关键词】

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副本交换 TRP-CAGE 熔解温度

【基金项目】

：

国家自然科学基金资助项目(10874104),山东省自然科学基金资助项目(Z2007A05)

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副本交换分子动力学模拟方法用来计算Trp-cage小蛋白的熔解温度.此模拟采用的是AMBER03的分子力场,但是它的电荷用最近发展的极化的蛋白质专一性电荷来代替.隐式溶剂模型用来模拟溶剂影响,温度变化范围从247.7 K到645.6 K.计算的熔解温度是312 K,这一结果和实验值吻合的很好(315 K).

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