SH3结构域序列集的统计耦联分析

来源 :物理化学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xsw2233
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基于蛋白质可折叠性和热稳定性具有长程相关性(Hp耦联性)的事实,使用改进的统计耦联方法分析了SH3结构域序列集中存在的祸联性信息.结果表明统计耦联方法采用的保守性统计能量可以较好地评估SH3结构域序列集的位点保守性,具有高平均耦联能量的位点可以基本上对应一些结构或功能上具有重要意义的位点.对统计耦联数据的一些位点扰动个案分析揭示出SH3结构中包含非紧邻扰动和紧邻扰动模式.统计耦联方法结合聚类重排可以对SH3折叠型序列群体中结构核心与非结构核心的位点进行区分,甚至可以区分其中几个功能相关位点的细节差异.SH
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