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为明确长期不同施肥方式对稻田土壤Cd、Zn和Cu积累及其有效性的影响，以设立于1986年的长期定位施肥试验为对象，对比分析不施肥（CK）、单施化肥（NPK）、秸秆还田配施化肥（ST）、低量有机肥配施化肥（LM）、高量有机肥配施化肥（HM）5个处理耕层土壤重金属全量、有效态、形态分布以及水稻各部位重金属含量变化，结合土壤理化性质变化，探讨了长期施肥下重金属累积效应及其有效性变化机理。结果表明，NPK和ST处理对土壤全量及有效态Cd、Zn和Cu均无显著提高效应。而施用低量和高量有机肥30 a后，土壤Cd、Zn和Cu全量显著提高35%～80%、63.91%～82.55%、118.41%～180.21%，有效态显著提高28.57%～71.43%、407.12%～783.15%、336.59%～573.17%，稻米Cd、Cu则提高100%～150%、63.30%～85.64%。相关分析结果证实，有机肥中较高的重金属含量是造成稻田土壤Cd、Zn和Cu累积和有效性显著提高的主要原因，同时其改变的土壤理化性质，尤其是P也会影响重金属的有效性，但其作用机理有待深入研究。总体来看，长期施用有机肥具有更好的培肥效应，但会造成土壤Cd、Zn和Cu的富集以及稻米吸收量的增加，虽然目前稻米重金属含量尚未超出国家食品卫生标准限值，其风险仍不可忽视，在采取有机肥培肥土壤的过程中应严格控制其中的Cd、Zn和Cu等重金属含量。