【摘 要】
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为了解类NADC30猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)在我国新的流行特点,本研究根据GenBank中美国2012年提交的PRRSV NADC30株全基因组序列设计合成8对引物,通过RT-PCR的方法对本
【机 构】
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中国农业科学院哈尔滨兽医研究所,黑龙江哈尔滨,150069山东信得生物科技有限公司,山东青岛,266100;南阳师范学院,河南南阳,473061;
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为了解类NADC30猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)在我国新的流行特点,本研究根据GenBank中美国2012年提交的PRRSV NADC30株全基因组序列设计合成8对引物,通过RT-PCR的方法对本实验室2016年从4个省搜集的临床样品中检测到的15株类NADC30 PRRSVs株进行了全基因组测序,并且结合参考株进行了序列分析.NSP2推导氨基酸的序列比对表明,15株PRRSVs均具有aa323～aa433+aa484+aa505～aa523(111+1+19) 131个氨基酸缺失的分子特征;经RDP4和Simplot生物学软件分析表明,15株PRRSVs中14株为重组病毒株,参与重组的亲本病毒株为PRRSV NADC30株,提供重组基因片段的病毒株为HP-PRRSV或以VR2332为代表的经典PRRSV株,这些类NADC30重组病毒株的重组位置、重组的基因片段及重组片段长度均具有多样性,而且重组的位置多位于编码非结构蛋白或次要结构蛋白的基因区域;全基因组遗传演化分析表明,这些病毒株远离国内之前流行的HP-PRRSV,同源性仅为83.4％～87.2％,而与其它的类NADC30病毒株位于一个相对独立的分支,以上结果均表明这类病毒株已形成了一个新的亚群,命名为5亚群.本研究中不同地区PRRSV的核苷酸同源性差异较大,仅为88.6％～99.6％,并且只有2个病毒株可以感染PAM和MARC-145细胞.本研究表明,以基因缺失和基因重组多样性为主要特征的5亚群PRRSV已在我国流行,其生物学特性有待进一步研究.
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