【摘 要】
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叶子花属(Bougainvillea Comm.ex Juss.)植物统称宝巾花,是重要的园林绿化树种,但尚未开发共显性、重复性好的分子标记.为了获得宝巾花的简单序列重复(simple sequence repea
【机 构】
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中国林业科学研究院热带林业研究所,热带林业研究国家林业局重点实验室,广州,510520;广西壮族自治区林业科学研究院,广西优良用材林资源培育重点实验室,中南速生材繁育国家林业局重点实验室,南宁,530
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叶子花属(Bougainvillea Comm.ex Juss.)植物统称宝巾花,是重要的园林绿化树种,但尚未开发共显性、重复性好的分子标记.为了获得宝巾花的简单序列重复(simple sequence repeats,SSR)标记,并分析品种的遗传关系,本研究基于转录组测序(RNAseq)组装的154 085条非冗余序列,在56 196条序列(36.47%)中检测到基序为1~6个碱基的SSR共60 239个,SSR的发生频率为1 SSR/2.34 kb.共有1 17种SSR基序,数量最多的3种基序为A/T (43 222个,71.67%)、AT/AT(4 009个,6.65%)和C/G(1 727个,2.83%).随机选取重复基序为2~6个碱基的147个SSR位点进行引物设计和合成,发现50对引物(34.01%)可有效扩增,其中16对引物(10.88%)在18个宝巾花品种中呈多态性,等位片段数(Na)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度He)和多态性信息量(PIC)分别为3~7(平均4.8)、0.17~1.00(平均0.525)、0.26~0.80(平均0.599)和0.25~0.79(平均0.544).利用16个多态性的SSR标记分析了18个宝巾花品种的遗传关系,结果表明品种间的遗传相似性较高,聚类分析中被分为两类,所有品种均可有效鉴别.这有助于理解宝巾花转录组中的SSR类型和分布特征,也为宝巾花遗传变异研究提供了有效的标记资源.
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