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以NCBI公布的EST数据为基础,通过一系列软件处理,连接成长175.294kb的无冗余EST序列324条,从23条序列中发现25个SSR,每7.011kb出现1个SSR位点。运用Primer3设计出引物15对,结合文献公布的11对引物,以46份中国芹菜品种及7份西芹品种的总DNA为材料,对EST.SSR在芹菜上的应用可行性进行验证,53份芹菜品种的12个微卫星位点共检测到32个等位基因,等位基因2(引物4)~4个(引物11),平均等位基因数为2.7个;并对53份材料的亲缘关系进行了鉴定。