高效毛细管电泳(HPCE)具有高灵敏度、高分辨率、高速度、样品用量低、成本低的优点。中药品种繁多,药材产地广泛,成分复杂。中药鉴别中应用HPCE主要用以区分真伪及产地。HPCE法还可用于多种中药有效成分的分离和含量测定,如生物碱、黄酮类、苷类、有机酸类、醌类、酚类、香豆素类等。中药复方制剂由多种药材组成,成分复杂,很多分析工作者成功使用HPCE对多种成分的同时测定进行了深入研究。中药安全控制主要包括毒性成分质量控制、非法添加化学成分和配伍禁忌。目前指纹图谱已成为国际公认的控制中药或天然药物质量最有效的手段。HPCE技术优势在于DNA、RNA等生物大分子的快速分析,探讨中药对特异性调节基因的影响及对肌体自身DNA修复机能的作用,从中筛选出疗效确切、针对性强、有应用前景的中药。利用毛细管电泳法测定制剂中主要有效成分在体内的药时曲线,测算其体内药代动力学参数。