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瘤头鸭精子分为头部和尾部。头部包括顶体和细胞核。顶体位于最前方。顶体下腔中有顶体突起。细胞核棒状,位于顶体之后。尾部由颈段、中段、主段和末段构成。颈段含有近端中心粒和远端中心粒。近端中心粒位于核后端的植入窝中。远端中心粒紧随其后。中心粒的外方有线粒体鞘。中段的中央结构是前轴丝(轴丝的前体),它与前方的远端中心粒相连。前轴丝的外方也有线粒体鞘。主段的中央结构是轴丝,它接于前轴丝的后端。轴丝外方有一圆筒状鞘。末段只有轴丝而无圆筒状鞘。整条精子外方包有细胞质膜。