【摘 要】
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背景:目前没有监测骨关节炎发生或进展的敏感标志物,检测骨关节炎活动期外周血基因表达谱变化,有助于探寻血液中精确的诊疗靶点及阐释发病机制.目的:通过生物信息学方法分析骨关节炎患者与正常人外周血淋巴细胞基因表达谱差异,从分子层面探索血液中骨关节炎的诊疗靶点,为研究骨关节炎提供新思路.方法:从GEO和ArrayExpress数据库中查找骨关节炎血液相关的芯片数据,并下载GSE63359数据集.筛选样本包括46例骨关节炎患者血液和26例健康人血液,其中女性患者32例(健康女性19例).用R语言limma包分别筛选
【机 构】
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广州中医药大学第三临床医学院,广东省广州市 510405;陕西中医药大学,陕西省咸阳市 712046;广州中医药大学第三附属医院,广东省广州市 510405
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背景:目前没有监测骨关节炎发生或进展的敏感标志物,检测骨关节炎活动期外周血基因表达谱变化,有助于探寻血液中精确的诊疗靶点及阐释发病机制.目的:通过生物信息学方法分析骨关节炎患者与正常人外周血淋巴细胞基因表达谱差异,从分子层面探索血液中骨关节炎的诊疗靶点,为研究骨关节炎提供新思路.方法:从GEO和ArrayExpress数据库中查找骨关节炎血液相关的芯片数据,并下载GSE63359数据集.筛选样本包括46例骨关节炎患者血液和26例健康人血液,其中女性患者32例(健康女性19例).用R语言limma包分别筛选出男/女性骨关节炎和男/女性健康人之间的差异表达基因,用ggplot2包绘制火山图,ComplexHeatmap包绘制热图.设定阈值为P0.5获取差异表达基因,然后制作韦恩图,得到8个差异表达基因:MAP2K7、CREBZF、CLK4、TRIM37、IL18RAP、LRRN3、BLNK和MS4A1;通过DAVID对差异表达基因进行GO和KEGG通路分析,并用R语言ggplot2包绘制气泡图.用STRING和Cytoscape软件构件PPI网络,Mcode和centiscape插件进行模块分析,Cytohubba筛选出关键基因.结果 与结论:共筛选出差异表达基因115个,其中上调基因16个,下调基因99个,对所有差异表达基因进行GO富集分析主要集中在“淋巴细胞介导的免疫”“体液免疫反应”“抗原受体介导的信号通路”“B细胞受体信号通路”“免疫球蛋白介导的免疫反应”和“吞噬作用的正调控”等生物功能上;KEGG主要富集在5条与骨关节炎相关的通路上:造血细胞谱系、Th1和Th2细胞分化、Th17细胞分化、破骨细胞分化和TNF信号通路.利用PPI网络及相关插件筛选出10个与骨关节炎高度相关的关键基因,其中瘤坏死因子、CD19、转铁蛋白受体、配对框5、丝裂原活化蛋白激酶7、CD24、CD20和B细胞连接器8个核心基因与骨关节炎炎症和细胞凋亡高度相关.提示:通过生物信息学分析发现骨关节炎和健康人的外周血淋巴细胞基因表达差异集中在炎症反应和细胞凋亡,从而使血液表达谱成为监测骨关节炎靶点标记物和研究其潜在分子机制的有效突破口.
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背景:目前,虽然临床上用于治疗膝骨性关节炎的方法很多,但传统的治疗方式所得到的临床益处较为局限.近年来,关节腔内注射自体骨髓抽吸浓缩物治疗膝骨性关节炎的研究颇多.目的:综述自体骨髓抽吸浓缩物治疗膝骨性关节炎的作用及机制.方法:以“骨髓抽吸浓缩物、膝骨性关节炎、骨髓间充质干细胞、转化生长因子β、血小板衍生生长因子”为中文检索词,在中国知网、万方、维普数据库检索相关文献;以“bone marrow aspirate concentrate,BMAC,knee osteoarthritis,KOA,Bone m
背景:腺苷酸活化蛋白激酶(AMP-activated protein kinase,AMPK)是一种分子水平的能量传感器,当机体处于低能状态时能被激活进而为神经元活动提供能量,但对于时间特异性敲除AMPK与认知功能障碍发生的关系尚未清楚.目的:探讨时间特异性敲除AMPKα1/2基因小鼠海马能量代谢与突触可塑性的变化,寻找能量代谢与认知功能之间的关键分子靶点.方法:将16只6月龄携带有AMPKα1/2flox/flox和Camk2a-cre/ERT2的AMPKα1/2flox/flox+CaMk2a-cre
背景:牙周病是一种牙齿支持组织的慢性炎症,这些组织的破坏导致牙齿缺失.牙周组织再生是牙周治疗的最终目标.目的:综述牙周膜干细胞的生物学特性及其在促进牙周组织再生方面的各种影响因素.方法:应用计算机检索PubMed、CNKI、万方、ScienceDirect、Medline数据库,以“Periodontal ligament stem cells,Periodontal tissue regeneration”及“牙周膜干细胞,牙周组织再生”为关键词,检索2004-2021年发表的相关文献.根据纳入排除标准
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背景:研究表明补肾益智抗衰方对阿尔茨海默病具有不同程度的治疗作用,前期研究提示同时促进脾脏巨噬细胞和中枢小胶质细胞向M2型极化有可能明显改善APP/PS1 Tg小鼠的认知功能.目的:探讨补肾益智抗衰方对阿尔茨海默病模型小鼠(APP/PS1 Tg)的治疗效果及其作用机制.方法:雄性8月龄APP/PS1双转基因小鼠(阿尔茨海默病模型小鼠,APP/PS1 Tg)随机分为阿尔茨海默病模型组和补肾益智抗衰方治疗组,取同性别8月龄C57BL/6小鼠作野生对照组,治疗8周.采用水迷宫实验和Y迷宫实验评估3组小鼠认知功能
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