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自然地理系统是区域可持续发展的三个重要系统之一,对区域可持续发展的影响较大。以牡丹江流域为例,结合地理高程、降雨量、径流量、水土侵蚀强度等自然地理敏感区划分的要素,确定区域划分方法,得出了将牡丹江流域划分为5个自然地理敏感区的划分结果,在分区概述的基础上给出了敏感区的影响范围,确定敏感区域的自然作用对流域经济产生的影响,为今后合理地规划产业布局以及区域生态保护提供参考依据。