【摘 要】
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为了利用生物信息学预测嗜吞噬细胞无形体ZJ-msp4蛋白的优势抗原表位,给寻找无形体病诊断和预防的候选抗原表位提供参考,试验参照GenBank中的msp4基因序列(登录号为EU008082.
【机 构】
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黔西南民族职业技术学院生物工程系,贵州兴义,562400;石河子大学动物科技学院/人兽共患病实验室,新疆石河子,832003
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为了利用生物信息学预测嗜吞噬细胞无形体ZJ-msp4蛋白的优势抗原表位,给寻找无形体病诊断和预防的候选抗原表位提供参考,试验参照GenBank中的msp4基因序列(登录号为EU008082.1)进行生物信息学分析.结果表明:ZJ-msp4蛋白的分子质量为30.1 ku,理论等电点为5.71,该蛋白的不稳定系数为29.13,组成较多的氨基酸有丝氨酸(Ser,13.8％)、甘氨酸(Gly,9.2％)、丙氨酸(Ala,8.9％)等;二级结构预测ZJ-msp4蛋白主要以无规卷曲、延伸链、0螺旋为主,TMHMM2.0预测该蛋白的第7～ 29位氨基酸可能为跨膜区,该跨膜区可能为信号肽序列;SignalP 4.1预测在msp4蛋白的N端第1～29位氨基酸序列为信号肽序列,该分析结果与TMHMM2.0分析结果一致;B细胞表位预测该msp4蛋白有11个线性表位,其中以28～38位、64 ～ 77位、87～101位、134～143位、245 ～264位是ZJ-msp4蛋白的优势抗原表位区段,可以作为诊断无形体病的候选表位.
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