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健全的大学学术问责治理机制是实现高等教育治理现代化的必然要求。当前我国大学学术问责面临着问责主体单一、问责客体模糊和问责程序不明确等治理困境。大学学术问责的治理困境主要由监管的行政性与学术的专业性的矛盾、学术研究的私密性与公益性的矛盾、问责主体与客体利益一致性的矛盾等现实缘由造成。通过学术问责治理形成有效的学术问责成果,由学术出版机构推动营造良好的科学研究氛围,通过学校及相关行政主管部门的多元联动形成内外互促的学术问责支持体系,进而实现学术"善治"。