临沂市脑膜炎/脑炎症候群监测病例埃可病毒30型的分离及其基因特征分析

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huang927
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目的 调查山东省临沂市脑膜炎/脑炎症候群(AMES)病例中人类肠道病毒病原谱的构成,分析主要病原体埃可病毒30型的基因特征.方法 采集AMES病例的脑脊液、粪便和(或)咽拭子标本,所有标本经预处理后,接种RD、Hep-2细胞分离病毒,阳性分离物采用血清学和分子生物学方法鉴定型别,与GenBank检索到的其他Echo30毒株进行同源性比较,并构建VP1完整编码区系统进化树研究其遗传进化规律.结果 2010年4-12月,共采集101例病例的222份标本(脑脊液56份,咽拭子94份,粪便72份),其中34例患者的47份标本(脑脊液4份,咽拭子18份,粪便25份)中分离到HEV,11例鉴定为Echo30.通过同源性分析,发现其核苷酸同源性与2003年山东省泰安市、章丘市及江苏省分离株最近(91.2%~95.4%),与原型株差异较大(17.9%~19.6%);11株临沂分离株之间核苷酸差异为0~10.2%.系统进化树分析显示,临沂分离株属于基因型6的3个不同分支,提示来自3个传播链的Echo30病毒在临沂市共同循环.结论 山东省临沂市2010年AMES病例标本的优势分离株为Echo30,与国外分离株属于不同的进化分支,具有不同的基因特征.
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