【摘 要】
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利用生物信息学与网络药理学建立人参-共同靶点-冠心病蛋白质相互作用网络图、人参-共同靶点-通路网络图,探讨人参治疗冠心病的分子作用机制。通过TCMSP数据库筛选人参的活性化合物和作用靶点,OMIM、Drugbank、Gene Cards、TTD及Dis GeNET疾病数据库检索冠心病作用靶点,得到人参-冠心病共同作用靶点,通过设置Degree值得到关键靶点。利用STRING数据库绘制人参-冠心病共
【机 构】
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中国中医科学院西苑医院心血管病中心
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(81874410);
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利用生物信息学与网络药理学建立人参-共同靶点-冠心病蛋白质相互作用网络图、人参-共同靶点-通路网络图,探讨人参治疗冠心病的分子作用机制。通过TCMSP数据库筛选人参的活性化合物和作用靶点,OMIM、Drugbank、Gene Cards、TTD及Dis GeNET疾病数据库检索冠心病作用靶点,得到人参-冠心病共同作用靶点,通过设置Degree值得到关键靶点。利用STRING数据库绘制人参-冠心病共同靶点的PPI网络图;采用Cytoscape3.8.2绘制人参-靶点-冠心病网络图,利用DAVID平台及R软件对人参和冠心病共同靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析,最后通过iGEMDOCK软件进行分子对接验证。结果显示①最终获得17个人参活性化合物,111个药物作用靶点,1886个疾病作用靶点,化合物-疾病交集靶点58个;②人参-冠心病共同靶点中的关键靶点有AKT1、TNF、PTGS2、IL1B、CASP3、JUN、NOS3;③GO及KEGG富集分析结果显示人参主要作用于TNF、cAMP、MAPK、PI3K-Akt、Toll样受体及NF-kB等多条信号通路,其中涉及免疫炎症、细胞增殖与凋亡等调节过程;④分子对接结果显示人参皂苷Rh2与PTGS2结合亲和力最强。该研究初步揭示了人参治疗冠心病的作用机制涉及改善慢性炎症、抗氧化、促进细胞增殖与抑制细胞凋亡等过程,通过分子对接与网络药理学的解析可为其治疗冠心病提供充分、可靠的理论依据。
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