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目的研究国内隐球菌临床分离株的遗传多态性和分子流行病学。方法选择与新生隐球菌遗传相关的9个微卫星标记,分析这9个位点从1993～2009年国内分离到的新生隐球菌临床株遗传背景、来源及变异程度。结果 116株被研究的隐球菌临床分离株,主要归属于3个微卫星复合物（MC2,MC3和MC12）,其中大部分为MC2（103株）。8株菌株属于目前为止未被国内外认识的新复合物（MC12）。结论利用微卫星DNA多态性研究新生隐球菌分子流行病学有较大的应用价值。