在党中央、国务院和广东省委、省政府的正确领导下，深圳市经过十多年的探索和实践，初步走出了一条有深圳特色的自主创新发展道路。
　　一是坚持以市场为主导。市场不仅是产生自主创新的原始驱动力，也是自主创新的目的和归宿。不被市场所认可的创新是没有生命力的。在推进自主创新的过程中，始终坚持以市场为导向，以产业化为目的，充分发挥市场对自主创新资源配置的基础性作用，利用市场调配资源，通过市场机制引导企业开展自主创新活动。多年来，通过不断的改革，清除影响市场机制建立的体制性和制度性障碍。比如，较早推行了企业管理制度改革，大力发展民营经济，建立以公司形式运作的现代企业制度；较早打破了单一分配制度，实行按劳、按资、按技术等多种形式的分配制度；较早取消了政府组织科技成果鉴定的制度，大力培育技术产权交易市场，由市场来评判技术的优劣。
　　二是坚持以企业为主体。突出企业技术创新的主体地位，也就在经济与科技之间找到了交汇点，以此为突破口“盘活”全社会的创新资源，形成完整的创新链。从世界各国发展的经验来看，一个国家或地区的核心竞争力主要是通过企业体现出来的。提升企业自主创新能力，也就是提高国家和地区的核心竞争力。深圳创新基础薄弱，高等学校和科研机构很少，现实的条件和客观的需要都要求我们从一开始就着力构建以企业为主体的自主创新体系。通过设立企业研究开发、专利申请、标准研制等专项经费，鼓励企业加大研发投入，开展自主创新活动；通过无息借款、贷款贴息或者贷款担保等形式，支持企业推广创新成果，扩大生产规模。同时，政府按照分类指导、突出重点、梯度扶持的原则，根据企业发展水平和不同梯次企业的需求，分梯次培育自主创新的企业群体，提供个性化服务，分门别类地解决企业创新过程中的实际困难，做大做强企业主体，逐步形成了自主创新的企业梯队和良好的企业生态。
　　三是坚持政府以服务为主。政府在自主创新中所扮演的角色既不是裁判员也不是运动员，而是场地的维护者。在自主创新中，政府积极主动地充当自主创新的战略规划者、推动者、服务者，营造良好的创新环境。围绕企业自主创新的需要，不断完善区域创新体系，积极建设各种公共创新平台和基础设施，资助建立了51家企业工程中心、48家企业技术中心、40多家创新企业孵化器，建成了一批公共实验室、科技信息、技术检测、产品设计等公共技术平台，帮助、支持企业的技改和研发活动，降低企业的创新成本；在土地资源十分紧缺的情况下，先后规划建设高新技术产业园区和高新技术产业带，为自主创新提供了尽可能多的发展空间；与清华、北大、哈工大等共同创建了清华研究院、深港产学研基地、国际创新研究院，形成了一批按照新机制运作的创新平台。
　　四是坚持引进与创新相结合。以消化吸收再创新为主。原始创新、集成创新和引进消化吸收再创新，对处于自主创新初级阶段的深圳来说，实施起来更为现实，其作用也更为重要。通信重大装备领域程控交换机的国产化历程充分说明了这一点。上个世纪九十年代前后国家开始实施程控交换机的引进消化吸收创新计划。深圳很好的抓住了这一机遇，1995年华为和中兴公司在消化吸收的基础上先后自行研制出大容量局用数字程控交换机，并迅速成为当时能与国际一流机型相媲美的机型。
　　五是坚持以人才为根本。人才是创新之本，是自主创新的第一资源。深圳历届市委市政府始终高度重视创新型人才，特别是具有创新精神的领军人物、创新型企业家的培养和引进，注重发挥人才的创造活力和带动效应。为此，我们不断清理妨碍人才有序流动的政策规定，鼓励人才合理流动；出台了创新人才可以以个人身份入户等引进人才政策；成立了引智办，举办人才“高交会”，设立留学人员创业专项资金，广泛吸引海内外人才；从今年开始，每年拿出2亿元设立创新人才奖，吸引和支持更多的创新型人才在深圳创业发展。通过提高市人大代表、市政协委员、市政府专家委员会委员中科技企业家的比重等形式，让科技企业家在重大的科技决策中发挥重要作用，保证了自主创新决策的科学性和可行性。
　　六是坚持以保护为核心。知识产权保护是激发自主创新动力和活力的核心要件。自主创新越是蓬勃发展，越要加强知识产权保护的力度。深圳制定了《知识产权战略实施纲要》并大力推进落实，完善了知识产权保护法规政策，强化知识产权保护执法，加大对侵犯知识产权行为的打击力度，有效地维护了企业利益，保证了正常的创新秩序，充分发挥了知识产权法律制度激励创新、保护创新的作用。