【摘 要】
：
【目的】为开发假眼小绿叶蝉Empoasca vitis分子标记,采用高通量测序技术对假眼小绿叶蝉DNA进行了测序与分析。【方法】本研究基于Illumina Hi Seq测序技术,构建了PE文库(~40
【机 构】
：
中国计量大学生命科学学院浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室; 浙江大学昆虫科学研究所水稻生物学国家重点实验室农业部农业昆虫学重点实验室;
【基金项目】
：
国家自然科学基金项目(31071744);浙江省教育厅课题(Y201534310)
论文部分内容阅读
【目的】为开发假眼小绿叶蝉Empoasca vitis分子标记,采用高通量测序技术对假眼小绿叶蝉DNA进行了测序与分析。【方法】本研究基于Illumina Hi Seq测序技术,构建了PE文库(~400bp),对获得的测序数据利用生物信息学分析手段完成全基因组扫描,并进一步使用MISA分析鉴定基因组序列中出现的微卫星序列(SSR)。针对微卫星序列共设计10对引物,并使用3步法进行引物多态性筛选。【结果】共计检测Scaffold数量为183 194条,其中包含SSR的Scaffold共计1 545条,共计筛选出1 569个SSR位点。在假眼小绿叶蝉的微卫星中,共包括87种重复基元类型,二核苷酸与三核苷酸重复序列为主要重复类型,分别占SSRs总数的70.26%和27.84%;二核苷酸重复基元CA/TG和三核苷酸重复基元AAT/ATT是优势重复基元,分别占SSRs总数的33.96%和5.86%。在设计的10对引物中,5对具有多态性,在8个假眼小绿叶蝉个体中共发现16个等位基因。【结论】结果说明假眼小绿叶蝉SSR位点在多态性方面具有极大的可开发性,具有多态性的SSR位点可对假眼小绿叶蝉种群间的分化,种群间的扩散机理和途径及影响因素等问题提供分子视角。
其他文献
分析了动荷段毁伤仿真实验与易损性评估的一般过程，应用V／L方法描述坑道工程动荷段毁伤分析空间转换关系，实现动荷段物理毁伤元和功能毁伤元的集成判定，设计容纳各种信息、算子、
本文首先研究了天线时域辐射远场的基本原理，建立了计算公式．在此基础之上，分析了相控阵天线工作在窄脉冲条件下的时域辐射场，发现其时域方向性（如：时域远场峰值方向图、时域远场平
<正>目的:(1)探讨Survivin基因在SKOV3细胞株中的表达状况;(2)初步探讨阳离子脂质体介导的反义Survivin寡核苷酸(antisense oligonucleotide,ASODN)对人卵巢癌细胞株SKOV3生
近年来,随着国民经济的快速增长和人们物质生活水平的不断提高,夏热冬冷地区居民普遍采用空调和电暖设备来改善冬夏季热环境。传统住宅由于围护结构保温隔热性能不佳,建筑能
从施肥、整形修剪、花果量调控、病虫害防治及避雨栽培等方面开展研究,总结东魁杨梅的高效栽培技术。
<正> 1959年由于久旱少雨,气候干燥,疫病萌生。自秋入冬,“传染性肝炎”继白喉之后,又散在的发现。患者多以儿童及青、壯年为多,因之影响学习和生产不小。党政領导对此极为重
工艺流程鱼糜解冻（或切削）→斩拌、配料、搅拌→充填涂片→蒸煮→火烤→冷却→轧条纹→束卷→涂色→薄膜包装→切段→蒸煮→冷却→脱薄膜→切小段→定量→真空包装→冷冻→贮藏
选取2007年夏季两次强度不同的致灾雷电过程进行对比，并将其能量参数与典型历史个例进行比较。结果表明：（1）副高位置、500hPa低槽移速、中尺度辐合系统以及热力结构的差异是导致
目的运用粗糙集理论对学生的成绩分析及数据挖掘,找出影响学生学习的因素.方法通过运用粗糙集理论对采集到的大学生学习过程中的大量数据进行属性重要度分析,对不必要的数据
电教媒体促进地理教学现代化□福建长乐一中郑其强随着我国经济建设的不断发展，电脑等现代化电教设备逐渐在中学教学中得到应用，作为中学必修课程的地理，在教学中如何运用现代化