【摘 要】
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为探明半夏属内物种的地理亲缘关系以及发掘有价值基因资源,促进新品种选育,利用Illumina HiSeq测序平台对半夏、石蜘蛛和滴水珠进行转录组测序,对获得的原始数据进行过滤处
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目“半夏珠芽发育的激素调节和关键基因克隆研究”(31560081)
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为探明半夏属内物种的地理亲缘关系以及发掘有价值基因资源,促进新品种选育,利用Illumina HiSeq测序平台对半夏、石蜘蛛和滴水珠进行转录组测序,对获得的原始数据进行过滤处理,去除低质量、接头污染以及未知碱基N含量过高的reads,之后进行de novo组装,最终获得Unigene,用软件MISA对测序数据中的SSR进行分析。结果表明:半夏、石蜘蛛、滴水珠转录组中分别有SSR位点19 270个、17 725个和16 585个,发生频率分别为17.06%、17.59%和18.67%,平均分布距离分别为3
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