利用预测的蛋白质序列裂解位点来定位凋亡蛋白

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凋亡蛋白对于物种发育和生物体内平衡的维持发挥着非常重要的作用。对凋亡蛋白的亚细胞位点的准确预测有利于理解细胞程序性死亡的机理和其生物学功能。本文利用SignalP得到的裂解位点将肽链分成N-端信号序列和成熟端序列。通过提取两端序列的氨基酸组分(ACC)、伪氨基酸组分(Pse-AAC)和整个链的立体化学特性来描述一条蛋白质序列。最后将得到的特征向量输入到支持向量机(SVM)中来预测其亚细胞位置。对三个凋亡蛋白基准数据集进行Jackknife验证,得到的总体精度分别为93.9%,87.6%,91.5%。此外我
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