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为建立与社会主义市场经济体制相适应的公共财政体系，我国对财政预算管理体系进行了创新，国库集中支付制度便是这次改革中的关键内容。在不断深入国库集中支付制度改革的过程中，国库集中支付系统的运用也日趋完善。但对科研单位，由于工作性质有其特殊性，该系统在实际应用中还存在一系列问题。因此，有必要针对这些问题进行完善和改进，以期能使国库集中支付制度发挥更好的作用。