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利用SSR分子标记对新疆喜盐鸢尾9个地理居群进行了遗传多样性研究。结果表明,新疆喜盐鸢尾具有较高的遗传多样性,6对引物共扩增出45个位点;物种水平上Nei’s基因多样性指数为0.2949,Shannon多样性指数为0.4672,种内总基因多样性为0.2949;居群内基因多样性为0.2468,71.58%的遗传变异存在于居群内,28.42%的遗传变异存在于居群间;居群间的遗传分化系数为0.2842,基因流为1.2593。UPGMA遗传距离聚类结果表明,生态地理条件相似的居群优先聚集。