【目的】研究添加生物炭对杧果根层土壤养分含量、根系生长和土壤微生物群落结构的影响，为杧果园科学施用生物炭提供理论参考。【方法】以台农一号杧果为研究对象，设置常规施肥（CK）、常规施肥配施3%生物炭（BC）和水肥一体化施肥配施3%生物炭（FBC） 3个处理，分析土壤养分和根系构型的变化，利用Illumina高通量测序技术比较土壤细菌和真菌群落的差异。【结果】与CK相比，BC和FBC处理土壤pH和有机质含量升高，果期BC处理的土壤碱解氮和有效磷含量显著升高，花期BC和FBC处理的土壤速效钾含量显著升高；果期BC处理的根质量密度和根长密度显著增加，根平均直径差异不显著，根盒维数表现为BC>FBC>CK。BC处理提高了土壤细菌物种数、丰度和多样性，降低了土壤真菌多样性；FBC处理降低了细菌的丰度和多样性；BC和FBC处理提高了变形菌门（Proteobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）、芽单胞菌门（Gemmatimonadetes）和担子菌门（Basidiomycota）等微生物门水平上的丰度，绿弯菌门（Chloroflexi）和子囊菌门（Ascomycota）丰度降低；BC处理的芽单胞菌属（Gemmatimonas）、鞘脂单胞菌属（Sphingomonas）和水恒杆菌属（Mizugakiibacter）显著富集，FBC处理的芽孢杆菌属（Bacillus）、Acidibacter、链格孢属（Alternaria）和青霉属（Penicillium）显著富集。冗余分析结果表明：有机质、碱解氮和有效磷含量是土壤细菌和真菌群落结构变化的驱动因子，pH是真菌群落结构变化的驱动因子，且根系生长发育受土壤环境因子调控。【结论】添加生物炭有利于提高杧果园土壤养分有效性，改善土壤微生物环境，促进根系生长。