副猪嗜血杆菌辽宁株tbpA基因鉴定与分析

来源 :沈阳农业大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fan8
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
副猪嗜血杆菌(HPS)是感染猪产生浆膜炎、关节炎、脑膜炎的病原菌,为明确辽宁省副猪嗜血杆菌tbp A基因的保守性、遗传变异情况以及功能,以复苏培养后的菌株为研究对象,利用细菌学常规技术和PCR方法对HPS及其血清型进行验证,将目的基因连接于T5载体上,并转化到大肠杆菌感受态细胞中,获得克隆质粒,对不同血清型该基因序列进行PCR鉴定。通过NCBI网站中BLAST进行序列比对,并且运用DNA star软件进行核苷酸同源性分析和遗传变异规律分析。通过在线软件对tbp A编码蛋白的氨基酸组成、分子量、等电点、亲疏水性以及二级结构等进行分析。结果表明:从保存菌的HPS中成功复苏了4型、5型、9型和14型菌株;经PCR扩增这4种血清型HPS的tbp A基因长度均为2700bp;tbp A基因与参考菌株核苷酸同源性范围为86.5%97.9%,4型和5型tbp A基因与84-15995、84-17975、H425亲缘性较近,9型tbp A基因与SW124和174亲缘性较近;14型tbp A基因与NO.4亲缘性较近;4种血清型tbp A基因与瑞典菌株D74在两个不同分支上,具有较远的亲缘关系。4种血清型tbp A基因编码蛋白分别有874,871,918,915个氨基酸组成;等电点分别为9.51,9.30,8.65,8.76;该蛋白属于亲水性蛋白;该蛋白的二级结构主要由α螺旋、无规则卷曲和伸展链构成。tbp A基因与美国株84-15995(KT588784.1)、德国株H425(KT588778.1)、日本株NO.4(KT588774.1)同源性相对较高,亲缘关系较近,但是也存在一定的差异性,该结果可为建立HPS最新基因突变跟踪提供参考依据;同时,通过对tbp A蛋白进行生物学信息分析,为进一步研究tbp A基因的功能奠定了分子基础。
其他文献
随着国家经济的发展,室内装修工作受到广泛重视,传统的装修方式已经无法满足其实际工作需求,企业应当遵循现代化装饰装修材料应用原则,根据消费者的审美要求等,合理应用先进
随着社会的进步、经济的不断发展,环境的变化受到越来越多的人得关注,人们开始重视人与自然环境的和谐共处。建筑行业作为现代产业的重要组成部分,其环保性也就显得尤为重要,
新时代的背景下,高校大学生思想政治教育面临着一系列的问题和挑战,文章从分析新时代大学生思想政治教育存在的问题入手,结合红色精神这一时代符号,逐步深入,探索将红色精神
<正>随着医学的发展、医疗水平的提高,医院感染已成为关系到医疗质量和病人安全的重要因素,可造成巨大的经济损失,因此医院感染的预防与控制受到卫生行政部门、医院管理者和
随着工业化、城市化进程不断加快,社会急速转型,农村土地被征收,农民面临着被搬迁且安置到新社区去开始新的生活。这是目前大环境下的一种必然趋势。面对此问题,失去土地的农
增强情绪自御力是提高工作效率和生活幸福指数的重要途径。自御力的提升策略主要体现在认识自己、控制情绪和应对环境等三个方面。
作为课程改革重要组成部分“综合实践活动”是陶行知教育思想的发展 ,推动了教育理念的变革 ,对实施素质教育 ,提高国民素质具有不可替代的作用。
煤矿生产安全一直是人们非常关注的一个问题,随着我国对能源需求的逐渐增大,近年来,对煤矿的开采力度也逐渐增大,煤矿生产是一项非常复杂的工作,施工过程中存在很多安全隐患,这也是
吉林省农业农村厅:《吉林省农业农村厅关于对肥料产品检测出农药成分适用法律解释的函》(吉农法函〔2020〕21号)收悉。经研究,答复如下。根据《农药管理条例》第二条之规定.
目的分析非透析慢性肾脏病(non-dialysis chronic kidney disease,ND-CKD)患者左心室结构和功能的改变及其影响因素。方法回顾性收集福建医科大学附属第一医院2013年1月至201