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本文提出了一种新的基于多序列比对1的入侵特征提取算法。该算法包括两部分：基于局部比对的两序列比对算法SLA（Sequence Local Alignment）和多序列比对算法MSA（Multi-Sequence Alignment）。SLA算法借鉴了生物信息学中两序列比对的思想,用局部序列比对思想和仿射空位罚分模型代替了目前在攻击特征提取中常用的全局序列比对思想和权值恒定空位罚分模型,以提高攻击特征的泛化程度。MSA算法利用一种新的剪枝策略来提高现有多序列比对算法在攻击特征提取中的抗噪声能力。本文详细介绍