中枢神经系统性原始神经外胚层瘤基因表达谱芯片的生物信息学分析

来源 :西安交通大学学报(医学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:healtw
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的 利用生物信息学方法对中枢神经系统性原始神经外胚层瘤(central nervous system primitive neuroectodermal tumors,CNS-PNETs)基因表达谱芯片进行分析,从分子水平探讨CNS-PNETs可能的发病机制.方法 从GEO数据库下载CNS-PNETs的基因表达谱芯片数据集GSE35493和GSE74195,利用GEO2R在线分析工具以及Venn软件筛选出差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并利用DAVID数据库在线分析工具对DEGs进行基因本体论(Gene ontology,GO)和通路富集(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析,通过STRING在线分析工具、Cytoscape软件及其插件cytoHubba对CNS-PNETs的DEGs进行蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析,寻找关键基因.结果 本研究共获得262个DEGs,包括49个上调基因和213个下调基因.GO功能和KEGG信号通路富集分析结果显示,DEGs涉及了DNA转录和有丝分裂核分裂、细胞分裂、运动行为、学习记忆和突触信号传递等生物过程,参与了细胞周期、肿瘤相关通路及p53信号通路、突触相关信号通路、cAMP信号通路及钙离子信号通路等.通过STRING分析筛选出10个关键基因:CDK1,CDC20,MAD2L1,KIF11,ASPM,TOP2A,TTK,NDC80,NUSAP1,DLGAP5.结论 包括CDK1在内的10个关键基因可能在CNS-PNETs发生发展中起重要作用.本研究为探索CNS-PNETs的发病机制提供新的线索.
其他文献
目的 探讨中性粒细胞与淋巴细胞比值(neutrophil-to-lymphocyte ratio,NLR)联合Integrated终末期肝病模型(integrated MELD,iMELD)评分对乙型病毒性肝炎相关慢加急性肝衰竭(hepatitis B virus-associated acute-on-chronic liver failure,HBV-ACLF)严重程度相关性评估.方法 选取符合标准的慢加急性肝衰竭(acute-on-chronic liver failure,ACLF)患者119例,
高钾血症是指血清钾浓度超过5 .5 mmol/L的一种病理生理状态,急诊发生率为3.6%[1].美国急诊每年高钾血症相关疾病超过80 万例,其中近7万例以高钾血症为第一诊断,45~84岁年龄段占75%[2].高钾血症具有潜在心律失常的致命性风险,尤其对有基础疾病患者.多项研究发现,老年患者高钾血症与心血管病病死率升高相关,增加室性心律失常的风险[3,4].武警特色医学中心消化科收治1例腹泻后高钾血症致严重心律失常的高龄患者,治疗效果良好.
目的 探讨胶质细胞源性神经营养因子(glail cell line-derived neurotrophic factor,GDNF)对糖尿病神经病理性疼痛(diabetic neuropathic pain,DNP)大鼠行为学的影响及机制.方法 将雄性SD大鼠50只随机分为对照组(N组,10只)、模型组(40只),造模后的模型组再随机分成DNP组(DC组,10只,仅给予10μl PBS缓冲液)、GDNF治疗组(DG组,10只,注射2μg GDNF+10μl PBS缓冲液).各组大鼠均测造模前,造模后第3
目的 探讨2种产地不同支架机械取栓治疗急性脑梗死的临床效果和卫生经济学成本.方法 选择铁岭市中心医院收治的64例急性脑梗死患者,全部应用支架机械取栓治疗.其中进口支架组31例,使用SolitaireFR支架,国产支架组33例,使用Reco支架.应用NIHSS评分评价患者不同时间节点的神经功能,采用mRS评分评价患者预后.比较两组患者临床疗效、不良事件发生率,以及卫生经济学指标.结果 治疗前、治疗后1、90 d两组NIHSS评分比较无统计学差异,但治疗后各时点均较术前有明显改善.治疗前和治疗后90 d两组m
热射病( heat stroke , HS )是重症中暑的一种类型,以核心温度升高>40 ℃和中枢神经系统异常为特征(如精神状态改变、抽搐或昏迷),并伴有严重的器官功能受损.老年患者病死率较高,65岁以上的老年患者可达40%[ 1-3 ].根据国家卫生健康委统计,至20 世纪末,我国60 岁以上老年人口超过10%, 2035年将超过30%,但目前尚未有针对老年HS的相关指南.
对近年来大骨节病(Kashin-Beck disease,KBD)和骨关节炎(osteoarthritis,OA)中软骨细胞自噬与损伤的研究现状进行综述.PI3K/AKT信号通路和mTOR调控软骨细胞的自噬活性;PI3K/AKT信号通路具有促进软骨细胞增殖的作用,并可通过抑制软骨细胞自噬活性引起细胞损伤.这可能在KBD和OA的发生和进展中具有重要作用,将为揭示骨关节疾病的发病机制和治疗方案提供科学依据.
目的:研究肺癌合并糖尿病发生呼吸衰竭患者的急救护理手段.方法:选择我院急诊于2019年3月—2020年6月收治的62例肺癌合并糖尿病发生急性呼吸衰竭患者,按照入院顺序平均分组后,实验组患者接受针对性急救护理,对照组患者接受常规急救护理,总结护理结果差异.结果:两组患者的血气水平、血糖等指标,结果显示实验组患者的PaO2为(73.29±4.29)mmHg,高于对照组的(61.73±4.36)mmHg,数据差异显著(t/P=12.359/0.001);实验组患者的PaCO2为(41.08±4.39)mmHg,
目的:在老年糖尿病合并脑卒中群体护理服务中融入延续护理服务的价值实施探究.方法:实验对象80例老年糖尿病并脑卒中人数于2020年1月至2021年1月时段选取,依照双盲法实施分组,每组试验对象为40例.参照组执行一般护理服务,研究组执行延续护理服务.分析比对试验自护行为、效果等指标.结果:护理服务执行后,研究组自护行为、自我管理能力、生存质量以及临床效果比较参照组均较优(p<0.05);研究组血糖水平控制较优,且数值低于参照组(p<0.05).结论:延续护理服务全面应用在临床上,糖尿病并脑卒中患者自我管理水
目的:研究5种不同的清洁方法对着色树脂基托和人工牙的清洁效果.方法:将着色后的树脂基托和人工牙试件根据不同的清洁方式随机分成5组(n=10),A:对照组,B:电动牙刷+蒸馏水刷洗3 min,C:电动牙刷+牙膏刷洗3 min.D:Polident浸泡5 min.E:Polident浸泡5 min+电动牙刷牙膏刷洗3 min.计算清洁前后的色差ΔE以及着色前和清洁后的色差ΔE.结果:对于树脂基托和人工牙,着色前与着色后ΔE值组间比较,P>0.05.清洁前后各组ΔE比较:E>D>C>B>A(P<0.05),着色
目的:分析临床干预周围性面瘫病患应用康复护理后对其生活质量的影响研究.方法:随机选取我院自2020年1月起开始收集病例,直至2021年10月截止,期间我院收治的84例患有周围性面瘫的病患作为临床研究对象,依照计算机表法将84例面瘫病患均分为研究组与对照组两组,每组病患人数均为42例,其中对照组应用传统护理干预法,研究组在对照组病患基础上使用康复护理模式,对比两组病患经临床干预后总满意度、及干预前、后病患生活质量、SDS、SAS等指标数值.结果:经临床研究得出,研究组病患护理满意度为(97.62%)其结果,