池蝶蚌(Hyriopsis Schlegelii)线粒体DNA COII基因的序列分析

来源 :南昌大学学报(理科版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:Zeshawn
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用细胞色素氧化酶II基因特异性引物,对人工选育后的F3代池蝶蚌的线粒体细胞色素氧化酶II基因进行PCR扩增和双向测序,在10个个体中均得到序列一致的细胞色素氧化酶II基因序列,长度为681bp;A、T、G、C含量分别为19.4%(132个)、30.4%(207个)、38.9%(265个)和11.3%(77个),A+T含量(58.3%)明显高于G+C(41.7%)含量,与其它淡水珠蚌科种类相同基因片段的碱基含量相似;密码子上4种碱基使用出现偏倚性,密码子第1位上碱基G使用率高达38.8%,碱基T为29.5%;密码子第2位上碱基T的使用率为38.8%,碱基C的使用率低至15.9%;密码子第3位上碱基T的使用率高达48.5%,而碱基C的使用率仅为4%;第3位碱基T的使用率比第二位高,这种递增现象也出现在高等无脊椎动物昆虫的COII上.BLAST结果显示池蝶蚌COII与三角帆蚌具有较高的同源性,相似性为95%,MP法构建的分子系统进化树表明这两种淡水珍珠育珠蚌的亲缘关系最近.
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