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目的：了解新疆医科大学6所附属公立医院收支及财政补偿的现状，为提出更加合理的财政补偿机制提供依据。方法采用回顾性调查的方法，收集新疆医科大学6所附属公立医院的2008－2012年财务报表数据，进行整理分析。结果2008－2012年新疆医科大学6所附属公立医院医疗收入占总收入的50．70％～52．15％，药品收入占40．17％～42．26％，财政补助收入仅占4．77％～7．89％。2008－2012年医院总收支差中药品收支差占44．42％～83．84％。结论政府对公立医院的财政投入比重严重偏低，“以药养医”