【摘 要】
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为建立一种快速鉴别严重急性呼吸综合征冠状病毒2 （severe acute respiratory syndrome coronavirus 2， SARS-CoV-2） 的5种主要变异株的TaqMan探针实时荧光定量PCR （real-time quantitative PCR， RT-qPCR） 体系，基于SARS-CoV-2野生型及变异株alpha （N501Y、HV69-70del）、be
【基金项目】
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国家重点研发计划（2019YFC1200603）；
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为建立一种快速鉴别严重急性呼吸综合征冠状病毒2 （severe acute respiratory syndrome coronavirus 2， SARS-CoV-2） 的5种主要变异株的TaqMan探针实时荧光定量PCR （real-time quantitative PCR， RT-qPCR） 体系，基于SARS-CoV-2野生型及变异株alpha （N501Y、HV69-70del）、beta （E484K、K417N）、gamma （K417T、V1176F）、delta （L452R、T478K） 和omicron （H655Y、N679K、P681H） 序列设计特异性引物、探针，建立和优化一种鉴别新型冠状病毒 （SARS-CoV-2） 5种主要变异株的TaqMan探针RT-qPCR方法，并进行该方法的特异性、敏感性、鉴别能力评价。该方法可准确区分出SARS-CoV-2野生型和突变型，与其他呼吸道病原体 （n=21） 无交叉，显示高特异性。该方法最低检测限为2×102拷贝/mL，操作简单、快速、成本廉价，可用于监测SARS-CoV-2毒株的变异，精准指导疫情识别与防控。
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