从科学角度解释，大佛闭眼流泪的真实原因是空气污染形成酸雨的后果。
　　世界最大石刻四川乐山大佛的头部，经过检测和日常养护，得到有效改善。乐山大佛开凿于唐代开元元年（713年），完成于贞元十九年（803年），历时约90年。以完成后的时间来计，这尊佛像距今1215年。在这1215年中，大佛裸露在外的时间有700多年。最初，建筑者们修建了大像阁这一巨型建筑来保护大佛，在南宋的《长江万里图》里，可以看到以前大佛所在的宫殿。但是，大像阁在宋元时期被毁。没有了遮风挡雨防光的保护，大佛常年经受风吹雨打和植被侵蚀。乐山大佛为何会花脸？一个重要原因就是生物病害，主要是由地衣、苔藓和其他生物藻类、霉菌所造成的。当地降水充沛，植物生长的季节性明显。降水丰沛时，地衣、苔藓会变成绿色，温度降低后它们会进入休眠期或死亡，这时大佛的头部就会发黑。尽管后人修葺时在大佛的头部和胸部设有保护层，但经过风吹雨打，保护层上还会附有极微量的泥土，可即便是这样的毫米级泥土，也足够苔藓类植物生存。
　　除花脸外，乐山大佛还出现过闭眼和流泪，分别是1962年、1963年、1976年、2000年。对此，民间有显灵等类似解释。但从科学角度解释，大佛闭眼流泪的真实原因是空气污染形成酸雨的后果。由于化石燃料的大量使用和工業建设、大兴土木，大气污染逐年加重，而且四川盆地空气湿度较大，酸雨沉降更为严重。受到空气污染导致的严重酸雨腐蚀，人们就会看到大佛眼睛下面像泪一样的水痕。经过清洗，就可以解决这一现象。
　　乐山大佛高71米，坐镇三江汇流处，全身沿凌云山天然山体凿刻。不过，凌云山的土质结构并不完全相同，在不同砂岩层之间夹杂了30～50厘米厚的泥岩层，形成了渗水和排水的不一致。建造大佛的古代匠人在大佛的螺髻耳部、胸部修建有排水槽和排水廊道，但由于砂岩渗水性很强，泥岩渗水性较弱，积水在其中堆积后并不能穿透外壳排出，再加上温差、湿度差等因素影响，造成岩石鼓起或开裂。
　　因此，如何保护大佛成为环境保护和建筑学的一项重大科研课题。根据历史记载，可以考证的对大佛的修缮已有14次之多。但是，正如人的疾病防治一样，也应当对大佛采用预防为主、“治疗”为辅的方针。目前，我国有30多处世界遗产正遭受空气污染的损害，峨眉山、泰山、黄山、武夷山等，都处于酸雨和其他有害气体污染的包围之中。减少污染，不只是在保护我们自身，也是在保护中国的世界遗产。