基于半参数回归模型的多区域单倍体型与纵向性状关联分析

来源 :上海交通大学学报:农业科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaoyaya310
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由于影响复杂性状的有些基因组单体型是有时间效应的,因此对复杂性状与基因组单体型的关联分析应该考虑时间效应。Zhang等提出的半参数模型不能直接应用于基因组单体型的分析。本文在Zhang等提出的分析纵向数据的半参数模型基础上,把模型的参数固定效应用来拟合单倍体型和其他固定协变量效应,时间效应通过二次可微函数来拟合,参数的估计按照Zhang等的方法,采用似然比检验来检验单倍体型效应。通过对我们升级的方法与一般的混合模型Haplo.stats和FAMHAP的htr模型进行模拟比较,证实对动态性状通过考虑多次采样
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