【摘 要】
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咸淡水的混合和重要营养盐与有机物的再循环,使得河口成为地球上生产力较高而动态变化明显的水生生态系统。一个典型的河口区断面中,细菌群落包含了一些从淡水到海洋的过渡类
【机 构】
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Stroud Water Research Center,970 Spencer Road,Avondale,PA 19311,USA; 天津科技大学海洋科学与工程学院;
【基金项目】
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美国自然科学基金(NSF)Microbial Observatory(MCB-0132070,MCB-0537041);Long Term Research in Environmental Biology(LTREB)(1052716);Meta-Ecosystems and the Upstream Legacy(1120717);海洋公益项目(201005015-1)
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咸淡水的混合和重要营养盐与有机物的再循环,使得河口成为地球上生产力较高而动态变化明显的水生生态系统。一个典型的河口区断面中,细菌群落包含了一些从淡水到海洋的过渡类型:例如a-变形菌(Alphaproteobacteria)、-变形菌(Betaproteobacteria)、?-变形菌(Gammaproteobacteria)、蓝细菌(Cyanobacteria)[聚球藻(Synechococcus)]、拟杆菌(Bacteroidetes)、放线细菌(Actinobacteria)和疣微菌(Verrucomicrobia)等。此外,河口也包含其独特的细菌群落:SAR11组、玫瑰杆菌属(Roseobacter)、SAR86和放线细菌(Actinobacteria)的一些进化亚枝(subclades),表明海湾或者大型温带河口区细菌类群具有区域生态适应性。以研究较多的美国切萨皮克湾(Chesapeake Bay)为例,其细菌群落呈现出显著的季节性变化和周期性的年际变化特征;这些变化除了受水的滞留时间和细菌生长速度影响外,还可能受其他许多环境因子的影响。其中叶绿素a和水温变化的影响最大,其他环境因子如溶解氧、铵态氮、亚硝酸盐和硝酸盐以及病毒的丰度也有影响。近年来,基于群落水平的基因组学(genomics)和后基因组学(postgenomics)(转录组学和蛋白质组学)技术应用于研究自然条件下微生物群落错综复杂的基因多样性和表达,提供了揭示水环境中微生物群落组成和新功能基因的途径。
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