本试验旨在研究巨大芽孢杆菌1259(BM1259)对产蛋鸡不同肠段微生物区系的影响。选用45周龄的健康新扬州蛋鸡128只,随机分为2组,对照组饲喂基础饲粮,试验组饲粮在基础饲粮添加2×106 CFU/g巨大芽孢杆菌1259。预试期1周,正试期3周,在正试期的第1、2、3周末采集小肠及其盲肠内容物和新鲜粪样,荧光定量聚合酶链式反应(RT-PCR)检测样品中微生物的含量。试验结果表明:1)小肠内容物中,第2、3周试验组沙门氏菌含量显著降低(P<0.05),第1、2周双歧杆菌含量显著提高(P<0.05),第2、3周巨大芽孢杆菌含量显著提高(P<0.05);2)盲肠内容物中,试验组巨大芽孢杆菌含量显著提高(P<0.05);3)粪便中,试验组大肠杆菌、沙门氏菌含量显著降低(P<0.05),第2、3周巨大芽孢杆菌含量显著提高(P<0.05);4)随着饲喂时间的延长,小肠内容物和粪便中沙门氏菌含量显著降低(P<0.05);小肠、盲肠内容物和粪便中巨大芽孢杆菌含量显著提高(P<0.05);5)分析同时表明,随着饲喂时间的延长,有益菌数量逐渐增加,有害菌数量逐渐减少。综上,巨大芽孢杆菌1259能有效抑制蛋鸡肠道中的大肠杆菌等有害菌的产生,促进乳酸菌等产酸菌的繁殖。