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近年来，科研经费管理问题凸显，阻碍了我国科研事业的发展进程，其严重性得到了国家各部门认识，逐步推行“放管服”改革，虽然收到了一定成效，但科研经费管理问题尚未从根本上解决，特别是2016年预算改革以来，科研经费预算管理中出现了新问题。本文介绍了农业科研事业单位科研经费管理中存在的一些问题，并针对这些问题提出了相应的建议。