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将“四个自信”思想贯穿大学本科教育是新时代国家发展的重要需要，是中华民族复兴的重要保障，是大学生健康成才的重要过程。在过去的现代医学史与科学史教学工作中，存在着对于现代科学与现代医学起源不清楚，有与传统文化对立等不良倾向。为了解决这些问题，2016年开始笔者在徐州医科大学部分本科班级开设全新的医学科学发展史课程。课程以问题导向型教学为手段，立足于自然科学与医学发展的内在规律，强调科学是每个文明对世界本源性问题的长期思索，中国传统文化与现代自然科学具有统一的内在核心。这是一次对科技史与医学史教育新的尝试，在文章中笔者概括性地总结了基本教学思路以及在培养学生的科学精神和研究自信方面取得的成效。