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目的分析不同居群的穿龙薯蓣及其近缘品种山药、盾叶薯蓣的亲缘关系，鉴别中药材穿龙薯蓣及其近缘品种。方法采用随机引物扩增多态性DNA（RAPD）技术扩增植物基因组DNA样品，利用NTSYS软件，建立了UPGMA聚类图结果从50条随机引物中筛选出清晰且多态性高的引物7条。共扩增出62条DNA片段。其中54条具有遗传多样性，多态率为92．71％。遗传相似系数在0．6595～0．875；应用引物S75，S313可有效鉴别穿龙薯蓣、盾叶薯蓣、山药。结论不同居群的穿龙薯蓣具有丰富的遗传多样性，DNA带型差异可准确区分穿