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以靶向化疗为代表的靶向抗癌治疗已有数十年历史,但其实际结果远未达到预期,对其进行方法学上的哲学审视已经不容回避。靶向抗癌治疗以局部的分子或信号通路为靶点,存在着对致癌病因作用与靶点功能之间辩证关系认识不清,对癌细胞、肿瘤微环境和癌症患者等各个层次的整体性、基于整体的自稳性及自稳机制重视不够,以及对潜在靶点数量的相对无限性认识不足等问题。因此基于分析-还原思维背景的靶向治疗应该融入整体思维,并导归整合医学。