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为明确小麦抗旱种质之间的遗传关系，27对SSR引物对50份小麦抗旱种质进行遗传差异分析，结果表明：27对引物共检测出127个等位位点，每对引物等位位点在2-8之间，平均4．7个。品种间的遗传相似系数变幅为0．46-0．89，平均为0．68，其中西农811与西农928间的遗传相似性最高，遗传相似系数（GS）高达0．89；山农16号与秦麦3号间的遗传相似性最低，GS为0．46。所选引物可以将全部品种区分开来，50个品种可分为8个类群，分类结果与品种系谱比较吻合。