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对球壳孢目真菌首次采用ＰＣＲ－ＲＦＬＰ和ＲＡＰＤ进行了系统发育研究，以ＩＴＳ１和ＩＴＳ４为引物对４属１２种２４个菌株的核糖体ＤＮＡ转录间区进行了ＰＣＲ扩增，４种内切酶酶切，结果表明：主要属的ＩＴＳ区长度不同，同属不同种相同。Ｃｏｎｉｏｔｈｙｒｉｕｎ，Ｐｈｙｌｌｏｓｔｉｃｔａ，Ａｓｃｏｃｈｙｔａ，ＳｅｔｏｒｉａＩＴＳ区长度分别为６３０，５６０，５５０，５４０ｂｐ；酶切图各间差别明显，属内种间基本一致