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剪股颖属植物形态变异大、倍性复杂、种间易于杂交，导致异名多、分类混乱。本研究采用4种分子标记技术，对包括匍茎剪股颖、巨序剪股颖及红顶草在内的7种剪股颖，共58个个体的遗传分化和系统关系进行研究。根据谱带清晰程度及多态性，筛选出9个RAPD引物、2个SSR引物、5个ISSR引物及1个SCAR标记，并建立了最适的PCR反应条件。采用最大简约法和距离法对7种剪股颖植物进行系统树分析，并用靴带检验法计算内部分支的支持率。启发式搜索得到的简约树和由UPGMA方法得到的表征树近乎相同，其中，匍茎剪股颖和红顶草构成单系